三元宫，旧名三官庙，系儒、佛、道三教合一寺院。位于大西门金锁桥东侧，前临市西河，左侧靠西门城墙，过去规模宏大，殿阁重重。原建筑面积2700平方米，庭院占地4100平方米，总面积5580平方米。
始建于清嘉庆年间(1796―1820)。道光二十四年(1844)重修。所谓“三官”，也称“三元”，系指道教所崇奉的神――天官、地官、水官。
据民国23年(1934)贵阳人许义宗所撰《三元宫乐善堂记》载：“宫始于清光绪戊子(1888)成于丁酉（1897）。先建大殿三层，堂开五楹，一层供三官、地藏；二层供关帝、吕祖；三层供上帝，配诸四相，气象巍峨，规模雄壮，改名三元宫。
当时修建的三元宫是一座三层大殿，大殿两侧建有钟鼓楼。先建大殿三层，堂开五楹，下层供三官、地藏；中层供关羽、吕洞宾；第三层供玉皇，两廊则为钟鼓楼，形成三进大院。光绪十八年(1892年)时，在大殿左侧建乐善祠和众乐亭。
己丑(1889)，加修左右两廊，各计三楹，上配钟鼓二楼。庚寅(1890)，补修山门、戏台一座，上加一阁。壬辰(1892)，又于左侧隙地建一乐善祠，用祀始事者诸同志焉。
乐善祠占地较广，上有经楼三座，下有两厢一厅，名曰望水厅。祠左有亭，名众乐亭。亭下有半月池。民国6年(1917)祠南临河处建明文阁。阁八面八角，高三层，达二十多米，圆甍筒瓦，飞檐凌空，内祀孔子、文昌、魁星。
民国8年(1919)阁旁修船楼，塑真武圣像于内。”至此，历经50余年，建成了有大殿、钟鼓楼、众乐亭、明文阁、船楼等楼阁为主体建筑群。曾是贵阳最大的道教活动场所。
整个建筑群含大殿、庑厅、经楼、祠堂、厢房、钟鼓楼、戏搂、阁楼、船楼、望水厅、众乐亭、半月池、石栏、石牌坊山门等，其规模之宏大，殿阁重重的气势，令人叹为观止。
民国26年(1937)，上述殿宇亭阁均已作他用，部分建筑被国民党政府社会部所属贵阳社会服务处用来开办旅社、餐饮、浴室等行业。
解放后，三元宫为省工商厅办公地，上述行业延续，浴室更名为贵阳市第二浴室，直到2020年拆除。1958年，省工商厅迁址，三元宫大部分建筑改为职工宿舍，住户达105家，因长期无人管理，房屋年久失修渐次破败。
1981年，三元宫被列为贵阳市第一批文物保护单位。1990年，贵阳市政府拨款将明文阁内两家住户搬出，并维修明文阁。2020年，紧挨着明文阁的船楼毁于火灾(2020年5月按原样恢复)。
2020年，贵阳市遭遇百年不遇水灾，三元宫主体建筑被作为危房拆除，拆除时发现墙内嵌入一块“道光二十四年重修三元宫”碑刻。
2020年，在三元宫主体建筑旧址上修建贵阳市美术馆和贵阳市群众艺术馆大楼，施工中此碑刻被毁。2020年，三元宫增建三清殿。
现三元宫组群建筑仅存明文阁、船楼、三清殿和一段大西门城墙。