教育部直属大学共七十六所，学校主要有北京大学、中国人民大学、清华大学、北京交通大学、北京科技大学、北京化工大学、上海外国语大学、上海财经大学、南京大学、东南大学、中国矿业大学等。
教育部直属高校名单
序号学校名称所在地1北京大学北京市2中国人民大学北京市3清华大学北京市4北京交通大学北京市5北京科技大学北京市6北京化工大学北京市7北京邮电大学北京市8中国农业大学北京市9北京林业大学北京市10北京中医药大学北京市11北京师范大学北京市12北京外国语大学北京市13北京语言大学北京市14中国传媒大学北京市15中央财经大学北京市16对外经济贸易大学北京市17国际关系学院北京市18中央音乐学院北京市19中央美术学院北京市20中央戏剧学院北京市21中国政法大学北京市22华北电力大学北京市23中国矿业大学（北京）北京市24中国石油大学（北京）北京市25中国地质大学（北京）北京市26南开大学天津市27天津大学天津市28大连理工大学大连市29东北大学沈阳市30吉林大学长春市31东北师范大学长春市32东北林业大学哈尔滨市33复旦大学上海市34同济大学上海市35上海交通大学上海市36华东理工大学上海市37东华大学上海市38华东师范大学上海市39上海外国语大学上海市40上海财经大学上海市41南京大学南京市42东南大学南京市43中国矿业大学徐州市44河海大学南京市45江南大学无锡市46南京农业大学南京市47中国药科大学南京市48浙江大学杭州市49合肥工业大学合肥市50厦门大学厦门市51山东大学济南市52中国海洋大学青岛市53中国石油大学（华东）青岛市54武汉大学武汉市55华中科技大学武汉市56中国地质大学（武汉）武汉市57武汉理工大学武汉市58华中农业大学武汉市59华中师范大学武汉市60中南财经政法大学武汉市61湖南大学长沙市62中南大学长沙市63中山大学广州市64华南理工大学广州市65重庆大学重庆市66西南大学重庆市67四川大学成都市68西南交通大学成都市69电子科技大学成都市70西南财经大学成都市71西安交通大学西安市72西安电子科技大学西安市73长安大学西安市74西北农林科技大学咸阳市75陕西师范大学西安市76兰州大学兰州市
注：教育部直属大学名单截至目前是76所，大多数学校是985、211高校，也有个别隐藏好大学。北京市教育部直属高校最多，为25所。