在世界奇石苑中，雨花石以玲珑剔透、小巧精美(直径一般为2-8厘米)，便于携带，深受各国旅游者的青睐。说起雨花石如诗似画的名称，本源自神话故事。相传南朝梁武帝(公元502-547年)时期，高僧云光法师在南京中华门外梅岗筑台讲经，精诚所至，感动上苍，天落花雨，入地化为五彩纹石，故称“雨花石”，讲经处遂更名“雨花台”。成语“天花乱坠”即由此传说而来，雨花石从此便成为南京的象征。
神话只是传说，不足令人信服。现代科学已揭开了雨花石的奥秘：雨花石生成的时期，大约是距今1200万年到距今300万年的地质年代，那时古长江流经南京六合以及仪征一带，奔腾的江水把中上游及附近山上风化的岩石、矿物冲刷搬运，磨棱化角，变成浑圆的卵石，再经沉积而成砾石层。这些砾石有玛瑙、玉髓、水晶、蛋白石以及含有各种矿物质的化石、纹理石等。
色彩斑斓的雨花石，其学名为原生玛瑙石，多数产自于六合县城东灵岩山南坡玛瑙涧。据宋杜绾《云林石谱》中记载，六合县水中或沙土中出玛瑙石，有纯白、五色者，呈透明、半透明状。这些玛瑙石就是我们所说的“雨花石”。
地矿学家考证，原生玛瑙石是若干万年前，地球岩浆渗进岩石内部的缝隙，二氧化硅慢慢分离，逐渐沉积成石英、玉髓和燧石或蛋白石的混合物。雨花石的颜色和花纹，则是在逐渐分离、不断沉积成无色透明体二氧化硅过程中的夹杂物。由于原生玛瑙石种类繁多，它的成因和化学成分极为复杂。一般认为，雨花石是由岩浆的残余热液形成的。这种热液充填在火山岩如玄武岩、流纹岩的空隙中，因空隙的形状不同，或成玛瑙球，或成玛瑙脉。经过自然力的作用，原生玛瑙脱落后经山洪冲击，流水搬运，磨成五彩斑斓的雨花石。所以今人有诗曰：地壳感动凝热泪，雨花缘是泪花滴。
雨花石以其纹奇、色艳的自然美著称于世。原生玛瑙的主要化学成分是二氧化硅，其次是少量的氧化铁和微量的锰、铜、铝、镁等元素及化合物。它的圈状花纹，是二氧化硅胶液围绕火山岩空隙、空腔，由内壁开始，从外向内多层次逐层沉淀而成。在其生成过程中，常常发生带色离子和化合物的周期扩散。赤红色的雨花石含有铁色素，蓝色的雨花石含有铜色素，紫色的雨花石含有锰色素，黄色半透明的雨花石含有二氧化硅胶体，翡翠色的雨花石含有绿色矿物色素等。同时，由于这些色素溶入二氧化硅热液中的种类和含量不同，因而呈现出浓淡、深浅变化万千的色彩，使雨花石极其艳丽秀美。
古人云：“山无石不奇，水无石不清，园无石不秀，室无石不雅。赏石清心、怡人、益智、陶情、长寿。”把雨花石放在手中，细细地把玩，那丝丝纹路、多多奇妙的图案，会把你带入神话般的境界;将它置于阳光下，七色光赋予雨花石闪耀、神奇、多变的灵性。雨花石自古以来备受人们的宠爱。春秋时期，一种产在扬州地区“似玉的美石”——号称“瑶琨”的雨花石，就作为贡品献给君王。历代名人爱石者甚多，周恩来总理曾经收藏雨花石，近代的画家徐悲鸿、京剧大师梅兰芳先生，也曾赏玩雨花石，汉城奥运会上中国体育运动员曾将雨花石作为中国的吉祥象征物，带到韩国。雨花石揭秘